型態上 heterogeneous，原始的 teratoid 腫瘤，分化成各種內胚層組織。含大量 epithelial pattern，且常表現 alpha-fetoprotein。肉眼下這些腫瘤通常是 encapsulated，平均直徑約 15 公分。切面柔軟，呈灰黃色或灰白，並常有許多壞死、出血與液化的區域。腫瘤邊緣可能有些 cyst 形成蜂窩樣的外觀。
雖然一個腫瘤中可以混雜著分化程度不等的各種部分，不過幾乎總有些地方具有其特徵可供診斷：疏鬆、myxoid stroma 中含有 microcystic、迷宮樣的空間，lined by flattened or clear epithelial cells，形成 reticular pattern。這些細胞具有程度不等的 atypia，細胞質中有些 PAS (+)、diastase-resistant 的 globules。這些細胞附近可以找到不規則的 hyaline 物質與 amorphous basement membrane 物質。另外，在 13~20% 的病例中，可以看見外覆上皮的 papillary fibrovascular projection，稱為 Schiller-Duval body。（與老鼠的胎盤絨毛相似）混雜的 pattern 可以分成：

• Microcystic or Redicular pattern：Vacuolated cell 組成的網狀／蜂窩狀結構。腫瘤細胞可能被空腔壓扁。細胞不大，但分裂很多。這是最普遍的 pattern。
• Macrocystic pattern：各種大小的薄壁空腔。
• Solid pattern：聚集成 nodular collections 的 polygonal tumor cells，細胞質 clear，核仁明顯，分裂旺盛，可見許多 hyaline globules。常可在週邊看到 microcystic 的地方。有些地方細胞會更 plemorphic，且可能出現 giant cell。這些地方可能看來像是 anaplastic change of dysgerminoma，或甚至是 clear cell tumor。
• Glandular-alveolar pattern：不規則 alveoli 的集合體，有類似腺體的空腔與 tubular structure。細胞可能從扁平到立方或角狀。
• Endodermal sinus pattern：結締組織的柄中有薄壁的血管。表面有一層立方狀的細胞，細胞質 clear，核仁明顯。
• Papillary pattern：很多細的 papillae，有結締組織的 core，可能是 loose & edematous 或 fibrous & hyalinized。
• Myxomatous pattern：Myxomatous tissue 裡有散布的細胞。
• Polyvesicular vitelline pattern：大小不等的 cyst 或 vesicle 被結締組織環繞。裡面有柱狀到扁平的 lining。一些 mesothelial-like cells 與 columnar PAS (+) epithelium 並存。
• Hepatoid pattern：Hepatoid cells，尤其易見於青春期後的男人。
• Enteric pattern：不成熟的 gland，單獨出現或聚集。有時候會像 teratoma 中的 gland，但缺少 muscle。
• parietal-type yolk sac tumor：非常稀少。AFP (-)。

各種 pattern 不一定均勻混合，通常是以其中一種為主。
免疫染色上，最重要的是 AFP。Cytokeratins 通常是 (+)，且可用來區分 dysgerminoma 或 solid yolk sac tumor。CD30 在 embryonal carcinoma 通常是 (+)，但在 yolk sac tumor 則只有 partial (+)。不表現 ER 或 PR，在卵巢，這點可區分它和 endometrioid tumor。另外卵巢的 clear cell carcinoma 表現 Leu M1，但 yolk sac tumor 不會。
不同部位的 germ cell tumor 型態相似，但有不同的臨床表現與預後。長在睪丸上的 yolk sac tumor 發生在兩種不同年齡：嬰幼兒，以及性成熟的男性。這是幼童最常見的睪丸腫瘤。在成人則常與其他 germ cell tumor 混合。症狀上則以不痛的睪丸腫塊做表現。卵巢的 yolk sac tumor 經過化療後，有可能形成 mesenchymal 多於 epithelial component 的情況，且分化成骨頭、軟骨肌肉等。
長在睪丸或卵巢的 yolk sac tumor 一般說來對化療反應不錯。形態學表現和預後關聯不大，不過在分化成熟的 glandular form，一些可能會有進展緩慢的 course 出現。

資料來源

• WHO Classification of Tumors: Tumors of the Breast and Female Genital organs, 2003
• WHO Classification of Tumors: Tumors of the Urinary System and Male Genital organs, 2004